代谢组是指生物体内源性代谢物质的动态整体。而传统的代谢概念既包括生物合成，也包括生物分解，因此理论上代谢物应包括核酸、蛋白质、脂类生物大分子以及其他小分子代谢物质。但为了有别于基因组、转录组和蛋白质组，代谢组之前只涉及相对分子质量约小于1000的小分子代谢物质，现在以上几种物质均有囊括。

　　

　　基于功能通路的关联分析策略：

　　该分析主要基于“参与同一生物过程中的基因或代谢物具有相同或相似的变化规律”。以相同生物学意义为基础，通过代谢组数据获得重要差异代谢物或重要代谢通路，联合转录组数据鉴定出重要代谢通路上发生变化的目标基因?；蛘叽幼甲槭萑胧?，经过差异分析获取大量差异基因，再结合代谢组数据，快速鉴定代谢相关的差异功能基因。多环芳烃是一种广泛存在的持久性环境污染物，可在植物的不同发育阶段发挥毒性。植物对多环芳烃的防御机制知之甚少

　　

　　广泛代谢组应用领域：

　　1、胁迫应答机理研究；

　　2、药用植物药用成分合成机理及药物代谢研究；

　　3、蔬果花卉颜色改良育种；

　　4、动植物生长发育机理研究；

　　5、疾病biomarker筛??；

　　6、疾病发生发展机制研究；

　　7、药效与毒副作用研究。